JabRef kann Inhalte einer BibTeX-Datei in eine MySQL- und PostgreSQL-Datenbank exportieren. Auch die Informationen zu Gruppen werden dabei berücksichtigt.
Dazu ist es nur nötig, eine Benutzer-Passwort-Kombination, die volle Rechte auf die Datenbank hat, zur Hand zu haben.
JabRef baut dann die Verbindung zu dieser Datenbank auf, löscht existierende Tabellen, erstellt neue Tabellen und fügt in diese den Inhalt der Einträge und Gruppeninformationen ein. Falls Sie ein weiteres Mal eine Verbindung zu dieser Datenbank aufbauen wollen, müssen Sie die Verbindungs-Informationen nicht noch einmal eingeben. Wenn Sie in eine andere Datenbank exportieren wollen, können Sie die Verbindungs-Einstellungen unter Datei -> Mit externer SQL-Datenbank verbinden (oder durch Klicken des entsprechenden Symbols) ändern und anschließend den Export durchführen.